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免耕下喜欢冷凉潮湿的植物疾病多发生在贫瘠且排水不良的粘土地上。 

     随着免耕时间的延续，耕层土壤的性状也随之发生变化。一般来说，土壤的通透性将向有利于作物根系生长的方向发展。 

病害对免耕作物产量影响不是很严重。免耕土壤通常不易干旱，而许多病在干旱条件下对作物产量影响显著。

管理疾病的最好方法是预防。 通常：

• 合理的土壤管理可以改善土壤结构，减低土壤压实，增加土壤通气透水性能，由此减少病害的发生率；
• 处理种子，防止种子腐烂和受潮；
• 合理轮作可以打破病害的发病周期；
• 轮作对免耕下的经济作物抗病更为重要；
• 选择适合当地生长条件的耐病和抗病品种；
• 好的营养管理有助于防病和抗病；
• 精心管理是好收成的保证。

虫害防治

同常规耕作下的作物相比，免耕条件使作物更容易遭受鼠类、昆虫、蛞蝓和线虫的攻击。不过，由于略为不同的生物栖息环境，免耕系统中上述问题有的变得严重，有的则变得不成问题。一般的控制方法和正常耕作管理下没有太大的区别。不同的是，免耕的害虫类型可能与常规耕作下农田的害虫有所差异。

作物残留物(活的和死亡的)在地表面形成一个保护壳。同常规耕作的土壤相比，保护壳下通常温度低些,湿度大些，因此减慢种子发芽，增大种子受害虫侵害的可能性。例如，夜盗娥和粘虫的生命周期就与前茬作物的类型有关。不过，有些益虫则喜欢免耕下的环境条件，例如小麦残留物吸引有益的螨虫。

免耕系统下生物多样性的增加，有利于土壤生态自我调节，不至于使某一种类生物过度发展。对很多害虫而言，尽可能消除杂草是对它们的最好防治方法。

玉米螟：幼虫头为暗黑或褐色，脊背上有黑或褐色的斑点。蛾为奶油色，夜间活动。新孵化的幼虫生活在叶鞘内，钻入植物体内食用玉米雄花、茎和玉米穗，使玉米易得茎腐病和倒伏。成虫可在玉米秸秆中过冬。春天形成茧，６月上旬转变为蛾。化学方法控制田间玉米螟效果不佳。选择抗倒伏和抗玉米螟品种，如Bt抗性玉米。Bt是thuringiensis细菌，可以使玉米免受玉米螟的侵害。粉碎玉米秸秆可有助于防治玉米螟，但要有规模才会获得好效果。

螨虫：小圆八脚虫，身体可为白、绿、红色，身体两侧有暗点。在大豆上，螨虫从叶片下面吸食叶中营养，使叶片呈现灼烧状。叶片下面象纺织而成的细丝线。如果侵害严重，叶子由黄转褐色，然后死亡。热干时节易发生此虫害。螨虫喜欢叶片汁液丰厚的绿色作物，大风有助于此虫在田间的传播。每片豆叶的螨虫如果超过4-5个，将引起减产。根据当地的条件选择农药防治。